Le jour de la naissance de James T. Kirk, son père meurt sur son vaisseau endommagé lors d'un ultime combat contre un navire minier romulien à la recherche de l'ambassadeur Spock, qui a grandi sur Vulcain, méprisé par ses voisins pour son héritage à moitié humain. 25 ans plus tard, James T. Kirk est devenu un jeune fauteur de troubles rebelle. Mis au défi par le Capitaine Christopher Pike de réaliser son potentiel dans Starfleet, il vient embêter les instructeurs de l'académie comme le Commandant Spock. Soudain, une urgence survient sur Vulcan et le nouvel USS Enterprise est doté d'un équipage de cadets prometteurs tels que Nyota Uhura, Hikaru Sulu, Pavel Chekov et même Kirk lui-même, grâce à la ruse médicale de Leonard McCoy. Ensemble, cet équipage vivra une aventure sur la dernière frontière où l'ancienne légende sera modifiée à jamais alors qu'une nouvelle version de la légende commence.